彭加木的失踪已经成为了一个谜，至今这个谜团也没有被解开。没有人知道当时是什么样的场景，也没有人知道彭加木当时究竟经历了什么？

但不管怎么说，可以肯定的是，彭加木是为了科研事业而失踪的。

抛开一些自然现象(沙尘暴、流沙)和超自然现象(空间之门、外星人、双鱼玉佩)的说法，关于彭加木失踪的原因还有一些其他人为因素的说法，比如说被外国人劫走了，比如说被谋杀。

1、被外国人劫走

彭加木是一个植物学家，从事过植物病毒相关的研究。有一种说法是，彭加木之所以多次进入罗布泊，是为了寻找一种病毒，一种可以感染人体的病毒，可以把人变成类似于丧尸一样的怪物。

早在上个世纪五六十年代，罗布泊便传出了沙人传闻。据说，当年一些进入罗布泊寻宝的年轻人，感染了这种病毒，变成了丧尸一样的怪物:

他们没有知觉，脚掌被沙子磨烂了也感觉不到，攻击性极强，会像疯狗一样相互攻击。

这个消息引来了一些别有用心的国家，他们尾随着彭加木团队进入了罗布泊，并在彭加木得到该病毒样本后掳走了彭加木，伪造成彭加木失踪。

2、谋杀

彭加木失踪前，曾留下过一张纸条，如下图所示。

这张纸条给人留下了太多不解，彭加木为什么要在如此恶劣的环境下独自一个人去寻找水源？为什么又要等到10点半才走？

彭加木失踪前，团队的携带的水源已经消耗的差不多了。当时绝大多数队员都倾向于向基地求助，让基地空投淡水。

然而 ，身为队长的彭加木考虑到从基地送水花费太大，坚持寻找水源。因此，彭加木和队员之间的气氛是比较凝重的。

有一种说法是彭加木经不住队员的请求，发送了求助信号，但是在得到反馈之时，彭加木已经独自外出寻找水源了。

还有一种说法是，彭加木并没有主动发送求助信号，一些队员为了活命，谋杀了彭加木，发送了求助信号，并伪造了纸条。

2005年，在彭加木失踪地点不足20公里远的地方发现了一具干尸，身上有多处受到伤害的痕迹，很多人怀疑这就是彭加木。

后来关于对这具干尸做DNA比对以及比对结果，都没有任何有效的消息再传出来。

至今为止，彭加木失踪之谜仍旧萦绕在大家心中。也许，根本就没有那么多玄乎的东西，彭加木失踪只是因为他想节省国家的钱而外出寻找水源，不幸被风沙掩埋了！

彭加木与罗布泊的故事牵扰着无数人的心，而他本人在第三次探险中失踪，更是成为了一个谜团，越发使得罗布泊蒙上了神秘感。

彭加木开展的第三次罗布泊考察开始于1980年5月8日，这一次他们走遍了整个罗布泊，于6月5日抵达了干涸的湖底，并顺利进入了他们梦寐以求的终点－楼兰。探险队在楼兰古城里呆了一周，真正的揭开了罗布泊的奥秘。考察队离开了楼兰之后，准备去乌鲁木齐。

6月16日下午2点，车上带的水和汽油都已耗尽，众人在驻地附近找水，但一无所获。晚上时，队员们商量着决定请求当地驻军救援，但遭到了队长彭加木的反对，因为救援花费太大，但拗不过众人，由彭加木亲自起草向当地驻军发电。

6月17日上午9点，当地驻军回电，表示已经安排了救援行动，可是在下午1点，司机王万轩到车里取衣服时，发现了一张彭加木留下的纸条，看后大吃一惊“我往东去找水井。彭，六月十七日十时三十”。这是最蹊跷的地方，上午九点驻军已经回电，而且距离不远，当天下午驻军就找到了他们，那么彭加木为什么要在10点还去找水呢？会不会是他在16日晚上因为反对请求救援，被众人合力谋害了，之后伪造成去找水的假象呢？这是不太现实的，首先，彭加木不会置众人生死不顾，而队员也不会残忍的杀害他们敬爱的队长。那么，彭加木究竟是如何失踪的。

在彭加木失踪之后，马上组织了一次大规模的搜救行动，出动了很多的人力物力。为什么呢？难道仅仅因为很缺少这一位植物学家，其实是众人在楼兰发现了惊天秘密以及无价之宝，而无论是秘密还是珍宝都在彭加木身上。

彭加木有过三次探险罗布泊的经历，第二次就是协助中日两国的电视台拍摄了一部关于丝绸之路、罗布泊以及楼兰的纪录片，在国际上引起了很大的轰动，也使得很多的不法之徒以及别有用心的国家盯上了罗布泊，盯上了彭加木。所以，彭加木的第三次探险，从一开始就已经被人盯上了。
在他们进入楼兰取得重大发现的时候，就已经陷入了死局，而这伙人本打算趁他们耗尽水、油，疲惫不堪的当晚下手，但由于众人通报了驻军，为了减少麻烦，他们只带走了彭加木与他所发现的东西，伪造成他去找水，将彭加木带回了这伙人的国家。